Väčšina riek Hondurasu je hornatá. A otvára sa zoznam najväčších riek v celej republike - Patuka, Ulua a Aguan.
Rieka Aguan
Rieka prechádza územím severného Hondurasu, pričom začína v departemente Yoro. Potom sa vydá na cestu, zvolí východný smer a prejde krajom departementu Colon. A cesta sa končí vtekaním do vôd Karibského mora (neďaleko Santa Rosa de Aguán). Celková dĺžka prúdu dosahuje takmer štyristo kilometrov. Aguana má niekoľko prítokov.
Údolie rieky sa aktívne používa v poľnohospodárstve. V doline v hornej / strednej časti toku sú zeleninové polia, ako aj kukuričné a fazuľové plantáže. Dolina dolného toku je daná ryžou a citrusovými plodmi. Pestuje sa tu aj palma olejná a platan.
Riu-Sumpul
Rio Sumpul si razí cestu krajinami dvoch štátov naraz - Salvadoru (jeho severozápadná časť) a Hondurasu (juhozápadné územia). Rieka je veľmi krátka - iba sedemdesiat sedem kilometrov - a po celej dĺžke slúži ako hranica rozdeľujúca územia týchto štátov.
Zdroj Rio Simpul sa nachádza v Salvádore. Rieka tam preteká niekoľko obcí (všetky sa nachádzajú v jednom departemente - Chalatenango). Vlieva sa do vôd rieky Rio Lempa.
Rieka Rio Torola
Rio Torola prechádza Strednou Amerikou, preteká krajinami Salvador (severovýchod) a Honduras (južná časť republiky). Celkové trvanie Rio Torola je niečo vyše sto kilometrov. Rieka pochádza z územia Salvadoru v mieste, kde sa rieka Lahitas spája s potokom Mansukupagua. Ústie rieky Rio Torola sú vody rieky Rio Lempa.
Rieka Ulua
Koryto rieky preteká územím Hondurasu v jeho severnej časti, pričom začína na pozemkoch departementu Intibuca (neďaleko La Paz, svahy hôr Cordillera de Mentesillos). Celková dĺžka prúdu je 358 kilometrov s celkovou spádovou oblasťou takmer dvadsaťtri tisíc štvorcov.
Rieka je tvorená sútokom riek Sasagua a Puringla. Proti prúdu je známy ako Rio Grande de Otoro. Rieka sa spočiatku rúti na sever, pričom tranzitne prechádza cez Santa Barbaru, ale potom sa Ulua prudko stáča na západ a obchádza tri oddelenia - Yoro, Cortes a Atlantis - dokončuje cestu vo vodách Honduraského zálivu.
Rieka Goaskoran
Goaskoran sa tiahne po chodníku cez krajiny Honduras a Salvador a prechádza krajinami v južnej časti. Dĺžka prúdu je zhruba stotridsať kilometrov so spádovou oblasťou dvetisícšesťsto šesťdesiattri kilometrov štvorcových.
Posledných osemnásť kilometrov prúdu je prirodzenou hranicou medzi týmito dvoma štátmi. Voda Goaskoran je zdrojom pitnej vody pre obyvateľov krajiny žijúcich na jej brehoch.