V roku 1663 dekrétom cára Alexeja Michajloviča začala výstavba pevnosti na Volžskej pahorkatine. Cieľom je brániť juhovýchodné hranice. Takto sa začína história mesta Penza a vskutku v mnohých ďalších mestách v strednom Rusku.
Epocha stredoveku
Pôvodnou misiou pevnosti bola ochrana pred Tatármi; obyvatelia okolitých dedín hľadali útočisko za jej spoľahlivými múrmi. Počet obyvateľov sa zvýšil a hostia z východu začali prichádzať menej často s dravými cieľmi. Začala sa nová, pokojnejšia etapa života mesta. Okrem toho zmenil aj svoj status, v roku 1719 vznikla provincia Penza a mesto sa stalo jej centrom.
V roku 1780 boli do histórie mesta Penza zaznamenané ďalšie zmeny, teraz to nie je centrum provincie, ale hlavné mesto guvernéra mesta Penza. Po 16 rokoch sa stáva centrom okresu Penza a provincie Penza. Koncom 18. storočia sa začína čas kultúrneho rozkvetu tohto osídlenia. V roku 1796 bola Penza vyhlásená za provinčné mesto.
Éra vzostupov a pádov
Začiatok 19. storočia v histórii Penzy bol skrátka poznačený určitým podrazom. Stalo sa to v súvislosti so zrušením provincie v roku 1801, respektíve s návratom Penzy do stavu krajského mesta. Je pravda, že toto obdobie trvalo krátko, provincia bola obnovená, Penza je jej hlavným mestom a štatút hlavného mesta provincie zostal až do roku 1928, až kým ďalšia administratívno-územná reforma nebola koncipovaná a vykonaná sovietskou vládou..
19. storočie je obdobím rozkvetu nielen pre Penzu, ale pre celé Rusko, priemysel sa aktívne rozvíja, objavuje sa železničná trať, zlieváreň železa, papierňa a hipodróm. Rozvíja sa aj kultúrna sféra - obyvatelia mesta Penza sú hrdí na to, že sa v ich meste objavil prvý ruský cirkus.
Éra blahobytu pokračuje na začiatku dvadsiateho storočia, potom Penza spolu s celým Ruskom zažívajú revolučné udalosti, zmenu politickej moci, vojny, kolektivizáciu a industrializáciu. História mesta je neoddeliteľná od histórie krajiny.
