Je to jedno z najstarších miest v Strednej Ázii. Dlhá história Buchary zanechala v meste svoje artefakty, najskoršie nálezy pochádzajú zo 4. storočia pred n. Mesto muselo počas stáročí veľa vydržať, obdobia mieru sa striedali s vojnami, výstavbou s deštrukciou, blahobytom a úpadkom.
Bukhara je starobylé mesto
Vedci identifikujú nasledujúce dôležité etapy v histórii mesta: Staroveká Bukhara; antické obdobie a stredovek; v úlohe hlavného mesta khanátu (do začiatku dvadsiateho storočia); od moci sovietov po súčasnosť. Navyše, ak hovoríme stručne o histórii Bukhary, hĺbková štúdia nám umožňuje v rámci každej etapy vyčleniť kratšie a dôležitejšie obdobia, významné udalosti a dátumy.
Už v dávnych dobách to bolo krásne mesto s jedinečným rozložením a elegantnými architektonickými štruktúrami. Srdcom Bukhary je pevnosť Ark, kde žili zástupcovia úradov. Obytné štvrte sa nachádzali bezprostredne pred múrmi pevnosti, potom - obchodné a remeselné predmestia.
Obdobie staroveku
Krásne mesto s úžasnými vyhliadkami sa opakovane stalo predmetom snov o blízkych i vzdialených mocnostiach. Mestu vládli predstavitelia perzskej achajmenovskej dynastie Alexander Veľký. Potom, už v 5. storočí nášho letopočtu, sa Bukhara stala súčasťou heftalitského štátu, v roku 603 sa začalo obdobie života ako súčasť sogdianskeho štátu.
V 7. storočí prišli do Bukhary Arabi, dejiny Bukhary sa neoddeliteľne spájajú s islamskou kultúrou, začínajú sa objavovať mešity, kultové komplexy a vzdelávacie inštitúcie. Orgány štátu Samanid sa navyše rozhodnú urobiť z tejto osady svoje hlavné mesto, v súvislosti s ktorým sa Bukhara aktívne rozvíja a buduje.
13. storočie je charakteristické neustálymi vpádmi mongolských vojsk, zajatím Buchary a protimongolskými demonštráciami obyvateľov mesta. Za Timura bolo hlavné mesto prevedené do Samarkandu, v ére Šeibanidov opäť získalo hlavné mesto, tentoraz Bukhara Khanate (XVI. Storočie), od roku 1740 - Bukhara emirát.
Na prelome storočí
Začiatkom 19. storočia to bolo jedno z dôležitých centier islamského náboženstva, krásne a rýchlo sa rozvíjajúce mesto. V roku 1868 Bukhara spadala pod protektorát Ruskej ríše, čo nemohlo ovplyvniť život obyvateľov mesta.
Je pravda, že dvadsiate storočie opäť prináša svoje vlastné úpravy v histórii Bukhary a celej ríše ako celku. Sovietska moc bola na území Bukhary a jej okolia založená až v roku 1920. V októbri získava mesto štatút Bukharskej republiky, ktorá, bohužiaľ, bola neskôr rozdelená medzi tri republiky (Uzbekistan, Turkmenistan a Tadžikistan). Od roku 1938 má Bukhara štatút regionálneho centra Uzbekistanu.